很久以前，在一个村主里有一个妇人，她没有孩子，所以非常希望有一个小宝宝。于是她就去请求魔法师，魔法师就送给她一粒种子，对她说：“把它种到土里吧，就能达成你的愿望了。”妇人拿着种子，高兴地回家去一了。
她找来工具，把种子种了下去。谁知，她刚把种子种下，这个神奇的种子马上就开出了一个漂亮的花苞。
妇人情不自禁地吻了一下花苞，花苞就目己打开了，而且里面还 有一个可爱的女娃娃，只不过这个小女孩长得非常小，只有拇指那么大。妇人很高兴，给她取名为“拇指仙童”。
白天，她以桌上的盘子作池塘，用花瓣当小船来游玩。到了晚上，拇指仙童就舒舒服服地睡在胡桃做的摇篮里，做着甜蜜的梦。
有一天晚上，一只蟾蜍潜进了妇人的房间，它一见到拇指仙童就十分喜欢，心想：“让我把她带回去，嫁给我儿子吧！”
于是，蟾蛛就把胡桃摇篮和拇指仙童，偷偷地带回家了。
到了早上，拇指仙童醒了过来，发现自己睡在莲叶上时，吓了一大跳。当她听说要嫁给蟾蜍时，更是吓得伤心地哭了起来。
“好可怜喔！我们来帮助她吧！”小鱼儿知道了拇指仙童的遭遇后，都十分的同情她。
他们合力咬断了莲花叶，莲花叶慢慢地漂流开了，拇指仙童非常感激他们，不断地向他们道谢。拇指仙童在河上漂来漂去。她遇到了蝴蝶姑娘，蝴蝶姑娘十分热心的说：“我也来帮忙吧！”
于是，它用带子把拇指仙童乘坐的莲花叶，拉到了岸边。
突然，飞来了一只金龟子，把拇指仙童抓走了。金龟子将她带到森林里的一棵大树上，并且神气地对同伴说：“我捡到了一个可爱的小女孩！”
但是，金龟的伙伴们却说：“哎呀！他只有两只脚！而且她没有胡子，真是难看极了！”
所以，金龟子们都很讨厌她，丢下了拇指仙童，就都跑掉了。
拇指仙童被丢弃在森林里，她吃花蜜，睡花叶，喝露水，孤单地过着日子。
不久，冬天来临了，天空飘着雪，花草也都枯萎了，拇指仙童没有食物可吃，只有以枯叶裹身，但是仍然寒风刺骨。
拇指仙童又饿又冷地在森林中徘徊，心想：“啊！好冷喔，肚子又饿，这样子下去，非饿死不可！”
拇指仙童一面打哆嗦，一面在雪中前进。终于，她发现了一间野鼠婆婆住的房子。
野鼠婆婆看见拇指仙童，十分同情的说：“好可怜啊！快进来吃点东西！”
于是，拇指仙童就在野鼠婆婆的家住了下来，每天帮野鼠婆婆做许多家事，过着快乐的日子。
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